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PORCINE COLONIZATION OF THE AMERICAS A 60K SNP STORY
BURGOS PAZ, W.; SOUZA, CA; MEGENS, H. J.; RAMAYO CALDAS, YULIAXIS; MELO, M.; LEMUS FLORES, CLEMENTE; CAAL, E.; SOTO, H. W.; MARTINEZ, R.; ALVAREZ, L. A.; AGUIRRE, L.; IÑIGUEZ, V.; REVIDATTI, M. A.; MARTINEZ LOPEZ, O. R.; LLAMBI, S.; ESTEVE CODINA, A.; RODRIGUEZ, M. C.; CROOIJMANS, R. P. M. A.; PAIVA, S. R.; SCHOOK, L. B.; GROENEN, MAM; PEREZ ENCISO, MIGUEL
El cerdo, Sus scrofa, es una especie extraña al continente americano. Aunque los cerdos introducidos originalmente en las Américas deberían estar relacionados con los de la Península Ibérica y las Islas Canarias, la filogenia de los actuales cerdos criollos que ahora pueblan el continente probablemente sea muy compleja. Debido a los climas extremos que alberga América, estas poblaciones también son un ejemplo único de un fenómeno de adaptación de rápida evolución. Aquí, ofrecemos un amplio estudio del genoma de estos temas por genotipado, con un chip de 60k SNP, 206 cerdos de aldea muestreados en 14 países y 183 cerdos de razas fuera de grupo que son fundadores potenciales de las poblaciones americanas, incluyendo jabalíes, ibéricas, internacionales y chinas. Los resultados muestran que los cerdos de aldea americanos son principalmente de ascendencia europea, aunque el paisaje genético observado es el de un conglomerado complejo.
Descripción:
The pig, Sus scrofa, is a foreign species to the American continent. Although pigs originally introduced in the Americas should be related to those from the Iberian Peninsula and Canary islands, the phylogeny of current creole pigs that now populate the continent is likely to be very complex. Because of the extreme climates that America harbors, these populations also provide a unique example of a fast evolutionary phenomenon of adaptation. Here, we provide a genome wide study of these issues by genotyping, with a 60k SNP chip, 206 village pigs sampled across 14 countries and 183 pigs from outgroup breeds that are potential founders of the American populations, including wild boar, Iberian, international and Chinese breeds. Results show that American village pigs are primarily of European ancestry, although the observed genetic landscape is that of a complex conglomerate.